醫學研究部(Department of Medical Research)
 

共 同 研 究 室 電 子 報   

第八十期 AUG.10.2020

本期目錄

主編的話

研究服務公告

高內涵螢光顯微影像系統原理及應用介紹

共同研究室貴重儀器訓練暨新知課程

下期主題

新一代RNA原位雜交技術

快速連結

臺大醫院

醫學研究部

前期電子報

我要訂閱電子報

聯絡我們

 

主編的話

高內涵螢光顯微影像系統 (High Content Imaging System) 藉由整合自動化取得多孔盤內細胞螢光影像和影像分析功能,使研究人員可以取得單一細胞多重生化或型態路徑數據,且可同時進行大規模實驗,目前已廣泛地被用在癌症、免疫、心血管和神經研究,提供多重定量資訊,例如細胞型態、 細胞內分子位置、細胞凋亡和細胞骨架排列等等 ,本期電子報以ImageXpress NANO機型為例,分享實際應用成果。下一期電子報主題為「新一代RNA原位雜交(RNA in situ)技術」,敬請期待,並竭誠歡迎您訂閱共同研究室電子報收取儀器介紹、研究新知、與每月訓練課程資訊,更歡迎您與我們聯絡,給予我們建議與鼓勵。


研究服務公告

共同研究室儀器線上預約系統近期新增顯微影像核心之全電動倒立螢光顯微鏡(200M)及第三共研之小動物血球分析儀等儀器,有使用需求之研究同仁請先申請開通預約權限,權限開通完成後即可自行進行預約,歡迎各位同仁多加利用。希望我們所提供的設備對您的研究有所助益,服務品質也令您滿意,為了共研長期的經營運作,請您於發表文章時惠予致謝共同研究室,作為服務成效評鑑之用。
 
                                        
 TOP                    


高內涵螢光顯微影像系統原理及應用介紹

金萬林企業股份有限公司 崔瑞廷經理

在生醫研究領域,顯微技術一直是不可或缺的重要工具,而現今研究不僅講求顯微影像解析度,更進一步要求能夠量化、具統計意義以及具再現性。ImageXpress系統因此應運而生,提供自動化高品質顯微影像擷取以及量化的研究利器。此系統可自動化拍攝玻片以及6-1536孔盤,拍攝全程使用雷射自動對焦與磁懸浮式載物台進行高精度影像擷取,並可對影像進行各樣定量分析,如: 蛋白質定量、細胞移動軌跡追蹤、apoptosisco-localizationmitochondria分析……等。本期電子報將以ImageXpress NANO機型為例,列舉實際應用如下:

應用範例:

1.細胞無標記藥物毒性檢測及分析

通過穿透光/相位差影像的方式,檢測細胞增殖、毒性、Clone形成,並可在無標記、完整細胞狀態下提供多參數、即時的資料。

1:不須螢光標定的細胞相位差影像及定量分析。右圖以穿透光拍攝之細胞影像;左圖以軟體定義「細胞」及「非細胞」大小後,即可自動計數細胞(綠色)。

2.神經毒性分析

包含神經退化性疾病、神經分化實驗等在內,神經細胞、組織的觀察一直是最主要的實驗之一,而所有藥物在開發中一定需要進行毒性/安全性測試,神經毒性評估即為其中之一。ImageXpress NANO可進行神經細胞拍攝與定量,如圖2所示,神經細胞iCell® NeuronsCellular Dynamics International))培養於poly-d-lysine coated 384孔盤7,500 cell/well48小時,再加入藥物測試72小時,最終用4% paraformaldehyde固定,再進行細胞核(如: Hoechst)與神經軸(如: β-tubulin III)螢光標定,即可使用軟體內建Neurite tracing/ outgrowth模組進行神經生長/毒性分析。分析參數包含cell numberoutgrowthbranchprocessneuron area……等。圖2中可清楚看到進行Methyl mercury作用後神經軸斷裂/萎縮的情況,亦可進行量化分析(圖3),在一盤的實驗即可完成數十種藥物的多濃度、duplicate測試。相較於傳統顯微鏡使用玻片與人工為主的實驗方法,高內涵螢光顯微系統可提高實驗效率並能進行後續量化分析,讓實驗能更迅速、客觀、準確。

2:神經細胞加入Methyl mercury培養72小時後,神經軸明顯斷裂、萎縮。

3:神經細胞加入不同藥物刺激後,量化神經軸生長情形。

3.原位細胞週期及凋亡檢測分析

監控細胞週期及凋亡狀態是一個非常重要的指標。與傳統檢測方法(如:流式細胞儀FACS)相比,全自動高內涵影像分析系統可對原位(無需懸浮處理)細胞進行全自動成像,並完成單一細胞的多參數分析。如圖4a,藥物作用後進行細胞核染色(藍色: Hoechst 33342;紅色: Propidium Iodide;綠色: YO-PRO-1),並使用高內涵軟體MetaXpress進行細胞週期與凋亡分析(圖4b)。透過細胞核大小與Hoechst 33342螢光強度,即可定義細胞週期階段(如:G2 phase細胞核大小與G1相當,但螢光強度為2倍)。再用細胞死亡染劑的標定,將死亡細胞核標定出來,即可確定在不同條件下細胞週期變化、細胞死亡比率等參數。

44a 細胞藥物作用後進行細胞核染色(藍色: Hoechst 33342;紅色: Propidium Iodide;綠色: YO-PRO-1)。4b 以高內涵軟體MetaXpress進行細胞週期與凋亡分析,將細胞核大小、螢光顏色、強度等參數定義後,分別以不同顏色標示所處之細胞週期階段,綠色-S phase、藍色-G2/M phase、淡藍色-G1 phase、紅色-apoptotic cell、橘色-dead cell

4.Long-term single cell trackingWound healing assay

利用ImageXpress Nano系統可進行長時間活細胞培養觀測,適用於如cell migrationwound healing等實驗,更可搭配內建MetaXpress軟體進行多細胞定量分析,計算細胞爬行位置、速率、角度,進而可分析chemotaxismotility等現象。如圖5,透過每20分鐘拍攝一次、連續11小時,各組別分別計算10顆細胞爬行位置,可看出HopQ轉植的細胞motility下降。

5:長時間連續觀察單一EV細胞及HopQ轉植細胞的移動情形。引用文獻: Cell Death Dis. 2020 Apr 14;11(4):231.

5.血管新生(Angiogenesis

透過抑制腫瘤內血管生成,進而抑制腫瘤細胞生長和轉移是抗癌藥物開發常用的方法之一。血管新生的實驗是以細胞型態影像為基礎,探討不同藥物、基因調控下血管生成的過程。此方法需進行3D拍攝方式、Z軸切層並重組影像獲得血管三維生長的完整資訊,藉以尋找抑制腫瘤生長時血管生長的藥物以及訊息傳遞模式。如圖6,在96孔盤中先加入Matrigel形成半固態的透明膠體培養環境,再加入血管表皮細胞(如:HUVEC)。細胞會在膠體中生長出如網狀的結構,最終使用染劑(如:Calcein AM)將細胞染色後使用高內涵系統進行3D拍攝與Best focus的影像平面化(2D projection),即可計算完整血管生成tube lengthtube area Number of segmentsNumber of branch pointsNumber of nodes等參數。

6:以高內涵系統拍攝血管新生情形。以3D拍攝後,利用軟體進行Best focus的影像平面化(2D projection),最後呈現影像如左圖即可呈現tube(白色)及node(綠色)。

6.GPCRG protein-coupled receptor活化試驗

GPCR佔蛋白表現基因約4%,包含嗅覺、視覺、味覺與細胞生長、免疫反應等都有相關。了解GPCR活化程度、會引起哪些種類的GPCR活化,一直是藥物開發、代謝機轉研究的課題。ImageXpress NANO可分析包含每個細胞GPCR活化程度,搭配GPCR-GFP fusion protein,更可進行即時藥物作用偵測反應。如圖7ß2AR expressed U2OS細胞受到不同濃度藥物刺激後,GPCR internalization程度可明顯看出差異,透過軟體定量即可算出各個藥物濃度在不同時間的作用結果。


7ß2AR expressed U2OS細胞受到不同濃度Isoproterenol刺激後,觀察GPCR internalization情形。上圖:以高內涵系統拍攝結果。下圖:利用軟體進行定量分析,將細胞以顏色屏蔽後,可明顯看出GPCR internalization(左下圖-紅色小點、右下圖-白色小點)。

7.腫瘤幹細胞細胞異質性研究

腫瘤幹細胞研究是目前新興的一個研究領域,腫瘤幹細胞對腫瘤的存活、增殖、轉移及復發有著重要作用。從本質上講,腫瘤幹細胞通過自我更新和無限增殖,維持著腫瘤細胞群的生命力;腫瘤幹細胞的運動和遷徙能力又使腫瘤細胞具有轉移的可能性;腫瘤幹細胞可以長時間處於休眠狀態,此時腫瘤細胞對能傷害腫瘤細胞的外界因素較不敏感,因此腫瘤往往在使用一般腫瘤治療方法消滅大部分普通腫瘤細胞後,經過一段時間又再度復發。

ImageXpress NANO系統可以運用96微孔盤,針對不同微環境下腫瘤幹細胞群體細胞的異質性、Clone細胞密度、Clone邊緣細胞群狀態、細胞形態、細胞大小、有絲分裂、凋亡狀態、病毒感染率、胞飲情況、脂滴形成等250個左右的參數進行檢查和定量分析。

8.組織切片掃描

高內涵影像系統也可以針對組織切片,進行高解析度掃描和整體影像拼接,如圖8所示,此為小鼠腎臟切片,影像拍攝完後自動進行拼接,再由紅、綠、藍三色疊圖而成。

8:小鼠腎臟切片大範圍掃描及自動拼圖

9.H2AX DNA damage assay

無論癌症、老化皆與DNA和染色體損傷有關,輻射照射、化學藥物等都是造成DNA損傷的因素之一,而γH2AXPhosphorylation of histone H2AX on serine 139即為早期辨識DNA雙股螺旋斷裂的標記之一,可透過γH2AX形成的數量來判斷DNA damage程度。ImageXpress NANO可進行高通量DNA damage藥物/抑制劑篩選,搭配免疫螢光染色,即可定義細胞在不同種類、劑量的藥物作用情況。

9a.DNA damage assay γH2AX染色示意圖;b.圖中左側為原始影像(紅色:細胞核、綠色:H2AX染色細胞核),右側為使用ImageXpress NANO計算遮罩圖(橘色為判定為H2AX positive 細胞核),可清楚定義一般細胞以及γH2AX positive細胞並算出DNA damage細胞比例;c.DNA damage細胞比率與藥物濃度關係統計圖。

TOP   


共同研究室貴重儀器訓練課程 

儀器訓練課程:課程網路報名

  0811 多功能全波長微盤分析儀與清洗儀原理與實機操作訓練(TECAN SPARK 10M)
  0813 IPA 生物分子路徑分析軟體服務介紹(基礎課程)
  0818 MycoSEQ™ Mycoplasma Detection Workflow for In-Process and Lot-Release Testing
  0826 IPA 生物分子路徑分析軟體服務介紹(進階課程)
  0828 自動化微需氧培養即時影像監控系統之研究應用與實機操作

研究新知課程:課程網路報名

  0814 即時顯微影像分析系統(CellInsight CX7 High Content Analysis)

歡迎您訂閱共同研究室電子報以收取儀器訓練與研究新知課程講習相關資訊 。

 TOP  


為持續提供優質之研究服務,便於日後聘用專職技術人員、購置新儀器、現有儀器汰舊換新與維護保養等等,敬請於使用共同研究室資源並發表論文時,於論文致謝(Acknowledgement)處加入致謝共同研究室之文句,並於論文發表時通知共同研究室管理人員。致謝文句請依實際使用情形書寫,或請參考以下範例:We thank the staff of the Core Labs, Department of Medical Research, National Taiwan University Hospital for technical support.
 

第八十期                                                                                                                                                                                                        AUG.10.2020