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第七十五期 MAR.10.2020

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主編的話

研究服務公告

漫談流式細胞儀FACSLyric的應用與發展

共同研究室貴重儀器訓練暨新知課程

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螢光標定技術於細胞顯微影像之發展與應用

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主編的話

本期電子報將介紹第七共同研究室新購置的流式細胞分析儀(BD FACSLyric),不同於原機型(BD FACSCalibur),新機配置藍光、紅光與紫光雷射,可同時激發10色螢光,具內建螢光補償功能,能依電壓調整即時修正補償數值,可簡化實驗流程,提升研究量能。下一期電子報主題為「呈現細胞原貌 - 螢光標定技術於細胞顯微影像之發展與應用」,敬請期待,並竭誠歡迎您訂閱共同研究室電子報收取儀器介紹、研究新知、與每月訓練課程資訊,更歡迎您與我們聯絡,給予我們建議與鼓勵。


研究服務公告

在動物研究上,需長期不同時間點觀察動物生理反應時,尾靜脈採血是一個重要的研究分析方式。但尾靜脈注射或抽血是一項需要手感且需大量練習的困難實驗技術,為協助有此項實驗需求的研究者減少失敗率及動物的耗損,第三共研採購了一組大鼠及小鼠尾靜脈注射器,此儀器可於尾部加壓,搭配下方強光源照射及放大鏡,幫助辨析血管位置,提高注射或抽血的精準度。歡迎有需求的研究者上網預約使用。臺大醫學校區學術演講及研討會公告平台提供各單位舉辦之演講及研討會公告園地,歡迎同仁查詢使用,並踴躍申請帳號發佈訊息。希望我們所提供的設備對您的研究有所助益,服務品質也令您滿意,為了共研長期的經營運作,請您於發表文章時惠予致謝共同研究室,作為服務成效評鑑之用。
 
                                        
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從細胞出發--漫談流式細胞儀FACSLyric的應用與發展

新加坡商必帝股份有限公司陳又楷專員

在過去的二十年間,流式細胞儀技術有著突飛猛進的發展,從早期僅可以同時偵測四個螢光,到現今最多可同時偵測至三十個螢光。除了儀器設計上不斷的精進改良,更結合了螢光聚合物的發明與生物細胞學的蓬勃發展,在現今學術期刊發表中,也可以觀察到流式分析的應用層面越來越廣;在臨床端也被視為細胞分群的標準方法學之一,扮演診斷與監控免疫環境變化的重要角色。

BD公司也在2018年推出FACSLyric流式細胞分析儀,承襲穩定的液流系統與靈敏的螢光偵測,搭配直覺化的操作軟體,提供更友善使用的分析平台。在雷射與螢光偵測器配置上,搭載藍光、紅光與紫光雷射,同時可激發10個螢光 (可偵測之螢光與濾片資訊如下圖),並可滿足八成實驗需求;此系統同時也具有高樣本收集效能 (35,000 cells/sec) 與極低的樣本殘留率 (0.1%)。軟體具內建螢光補償數值,上樣時,依據電壓調整即時修正補償數值,達到最簡易使用與高效率的目的,幫助提升研究質量與動能。

IPA生物路徑分析軟體當中,其分析功能可分為資訊查詢以及數據分析服務,在查詢的部分,您可以透過IPA收錄的數百萬筆生物資訊,快速尋找您感興趣的基因、疾病及分子調控方式。而在分子數據意義分析上,IPA提供多樣的分析與結果表示方式,包含生物訊息核心分析 (Core Analysis),使用者可將實驗中的基因體、轉錄體或者蛋白質體資料上傳至IPA,並且透過篩選工具選擇出關注分子,利用IPA尋找相關的生物路徑或者疾病與細胞功能。而比較分析 (Compare Analyses) 可利用Heatmap同時瀏覽多筆資料的,將結果進行全面性的比較。

圖一、FACSLyric搭配之螢光偵測器

而流式細胞分析技術是一門定量分析的方法學,透過液流帶動懸浮樣本通過雷射光,當細胞通過雷射時,激發標定於細胞上的螢光物質,最終偵測螢光訊號與散射光,反映出樣本特性,達到鑑別特殊細胞族群等目的。因為使用液流系統推動樣本,每秒鐘可偵測到數千至萬顆細胞,屬於高通量分析方法,也非常適合分析稀有細胞族群。流式細胞儀可應用於各式各樣的分析實驗中,例如標定細胞表面抗原的免疫分型實驗、胞內抗原分析、測定細胞內部DNA含量、細胞週期、細胞增生與凋亡試驗、外泌體檢測等,甚至可以使用流式測定蛋白質的絕對濃度,以下將替大家說明幾種常見的應用。

1.免疫分型 (Immunophenotyping)

免疫分型為流式細胞儀中最常見的應用,透過偵測免疫細胞上特異性抗原或是抗原組合,作為標誌 (Marker),例如T細胞同時表現CD45CD3;而B細胞則帶有CD45 CD19,透過這些特有的標誌,協助我們從樣本中找出目標細胞群。

圖二、6色分析全血中淋巴球細胞

此類型實驗在過去已累積很多的經驗,有許多細胞分群與多色螢光配置的資訊刊載於Cytometry Part A期刊,尤其是Optimized Multicolor Immunofluorescence Panel (OMIP) 專刊,這些多色實驗結果已經過驗證和發表,是開發各種免疫應用的公開分享資源,可作為實驗設計的參考。

OMIP: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/toc/10.1002/(ISSN)1552-4930.OMIPscollection

2.胞內染色 (Intracellular staining)

除了標記表面抗原進行分型之外,我們也可以透過通透與固定液的處理,在細胞膜表面造出許多微小孔洞,進而偵測胞內抗原,包括細胞激素、轉錄因子與磷酸化蛋白質等,幫助了解細胞特性。例如研究調節性T細胞 (Treg),已知表面抗原型為CD25HiCD127low,其轉錄因子FoxP3也是特定的表現抗原,在內染的幫助下更能精準定義Treg細胞族群。

圖三、淋巴球染色實驗, Treg細胞分型為CD4+CD25highCD127dimFoxP3+ (colored blue)

3.細胞週期分析

真核細胞在環境與狀況良好時,先行複製後進入有絲分裂期,由母細胞分裂為兩個子細胞,此循環稱為細胞週期,胞內染色體的總量隨著每個階段而變化。目前已有多種試劑可供研究細胞週期,例如PI7-AAD,透過DNA染劑,可觀察DNA含量更迭。如果在細胞週期的S(DNA合成) 時期,加入BrdU試劑,BrdU會在複製過程中替代thymidine,並透過BrdU抗體偵測,可取得更精確的效果。

圖四、7-AADBrdU合併分析細胞周期之變化

4.微珠免疫分析試驗 (Cytometry Beads Array, CBA)

CBA是流式細胞儀絕對定量的方法之一,用於偵測水溶性蛋白及外泌性蛋白,包括細胞激素、趨化因子、生長因子及訊號傳導磷酸化蛋白等,最高可同時偵測多達30種蛋白質,適用於血清、細胞培養液等樣本。

圖五、微珠免疫分析試驗的簡易流程與步驟

偵測原理主要以螢光微珠為主,每一種微珠上只會接合一種專一性抗體,同時每種微珠的自體螢光強度不一,藉此方法,同一反應中可混合多種微珠,測定多種蛋白。將微珠、待測樣本與偵測抗體混合反應後,上機收取結果。並透過標準品與平均螢光強度 (MFI) 計算出標準曲線,最終換算得待測之絕對濃度。

圖六、以標準品之螢光強度繪製標準曲線

以上說明之應用僅為部份分析實驗,凡能製備為單細胞懸浮液,待測物的粒徑介於0.2 - 50 uM的樣本,皆可以使用流式細胞儀進行偵測。最新研究趨勢甚至將流式分析結果與演算法結合,依照每顆細胞所展現的螢光特性進行計算,虛擬出視覺化的分布空間,幫助了解樣本中所有細胞分群,擴大觀測視野。也期望透過良好的分析工具,支持科學進程,並協助大家探查未知的領域,增加研究的質與量。

圖七、tSNE演算法分析28色螢光標定之健康人血樣與分群結果 

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儀器訓練課程:課程網路報名

  0311 ​生物能量代謝測定儀(Seahorse XF24 Analyzer)
  0316 大/小鼠尾靜脈注射器操作 
  0324 螢冷光影像分析系統實機操作訓練課程​​(UVP-810)
  0331 流式細胞儀(BD ; Lyric)實機操作

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