醫學研究部(Department of Medical Research)
 

共 同 研 究 室 電 子 報   

第六期 JUN.10.2014

本期目錄

主編的話

核心研究服務公告

細胞免疫影像分析儀

流式微粒螢光分析儀

科學新知

共同研究室貴重儀器
訓練暨研究新知課程

下期主題

研究服務項目: 
 磁場/磁珠細胞純化儀
 

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主編的話

酵素免疫分析法 (Enzyme-linked immunosorbent assay)為常被應用於生物醫學研究的實驗方法之一,本期電子報介紹的細胞免疫影像分析儀(ImmunoSpot Analyzer)和流式微粒螢光分析儀(Luminex)兩項儀器,皆是以酵素免疫分析法為基本原理所發展出的分析方法,再借助儀器達到自動化分析功能,可廣泛應用於不同研究領域。本期電子報另介 紹醫學院第一共同研究室的基因剔除(剔入)細胞株核心服務,期望能協助同仁的研究與應用。下一期電子報將會介紹建構於磁場/磁珠平台的細胞純化儀,目前共同研究室提供研究用與臨床用之細胞純化儀,有需要的同仁請密切注意下期的電子報喔!歡迎您訂閱共同研究室電子報以獲得相關訊息。同仁對於共同研究室如有其他新的研究服務需求,更歡迎您與我們聯絡,給我們建議與鼓勵。


核心研究服務公告

各位同仁大家好,為協助醫學校區學術研究,醫學院研究發展分處第一共同研究室在20144月於人類疾病模式生物中心(Human disease modeling center)底下增設基因剔除(剔入)細胞株核心實驗室(Gene Knockout/in Cell Line Modeling Core),由黃呈彥博士(cyh0729@ntu.edu.tw)負責相關業務。服務與收費方式請詳見第一共研網頁另外醫院共同研究室新啟用的「流式細胞分選儀 」正熱切開放服務中,歡迎大家多加利用(預約規則請參閱醫研部網站)
 
                                        
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細胞免疫影像分析儀(ImmunoSpot Analyzer)


 
ELISPOT (Enzyme-linked immunospot),亦可稱為ImmunoSpot;此分析方法發展之初是為了偵測B細胞所分泌的微量抗體。一般而言,偵測外泌性蛋白的常用平台為ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay)ELISA是待細胞完成分泌反應之後,取其培養液進行免疫聯酶反應,若細胞所分泌的蛋白濃度太低,往往無法被偵測到。在1983年,Dr. Cecil Czerkinsky改良實驗流程,將capture antibody附著在培養盤底部,再將細胞連同刺激物(例如:抗原)加入一同培養。若細胞受到誘導產生外泌性蛋白,就能立即地被培養盤底部的capture antibody抓取,避免稀釋在培養液中,接著進行類似ELISA的呈色反應(圖一)。在1996Dr. Paul Lehman應用PVDF作為ELISPOT的底盤,改善原本塑膠培養盤對抗體的親合力差的問題,進而開發出世上第一台ELISPOT分析儀,讓ELISPOT被廣泛採用。

          圖一、ELISPOT原理

ELISPOT實驗流程中,抗原特異性T細胞(antigen-specific T cell)會與抗原呈現細胞(APCs)和特定或欲測試的抗原(antigen)一起培養來模擬免疫反應,後續進行呈色(如圖一),最後由細胞免疫影像分析儀自動掃描96個樣本,耗時大約2分鐘,再由分析軟體進行斑點數目分析與資料處理,藉由每個well產生多少個斑點(Spots)和斑點大小作為免疫反應的指標,來推論活化T細胞顆數與其分泌相對應量的cytokine

在傳統ELISACBA (cytometry Beads array)ICS(intracellular cytokine)RT-PCR所得到的數值中,研究者無法明白有多少數目細胞分泌特定的cytokine,難以區分是少量細胞分泌大量的cytokine或大量細胞分泌少量的cytokine,而這些檢測數據皆代表重要的研究資訊。人類PBMC在沒有任何抗原刺激下,細胞本身就會分泌少量的cytokine,經過正確的抗原刺激後才會產生大量且專屬的cytokine,例如:HIV感染患者的PBMC偵測IFN-γ時,正常人和患者在IFN-γ形成的斑點數上並無明顯差異,但病患的斑點大小卻只有正常人的1/10,所以HIV並不是影響病人體內活化T細胞的數目,而是抑制了活化T細胞分泌INF-γ的能力。由ELISPOT可反映出細胞分泌細胞素(cytokines)的真實狀況。此外,ELISPOT可應用在偵測疫苗施打後的細胞記憶性,例如:疫苗施打後,取出免疫細胞與專一抗原或peptides培養後進行呈色反應,由斑點的大小與多寡可得知測試的疫苗是否可以喚起免疫細胞的記憶性,進而產生細胞素或抗體反應。

近年來,ELISPOT儀器發展快速,陸續有雙色免疫斑點分析(Dual Color ELISPOT/圖二a)和螢光免疫斑點分析(FluoroSpot/圖二b)的機種出現。

圖二a                             圖二b

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流式微粒螢光分析儀

xMAP (Multi-Analyte Profiling) technology 是利用傳統免疫聯酶反應來達到同時分析多種標的之multiplexing技術平台,Lunimex公司的專利技術。有別於一般ELISA方法將抗原附著在培養盤底部,xMAP technology先將antibody (probe)接合在具有螢光A5.6μm polystyrene bead 6.5μm magnetic bead (新一代beads),與待測樣品反應後,若樣品內含有相對應之標的物antigen (cytokineschemokinesgrowth factors)即會接合上此bead。再來,加入會與該標的物反應的第二種antibody(含有螢光B標定﹔(如圖三)。不同抗體可設計結合在不同螢光強度的polystyrene beads,經雷射激發後可以被鑑別出來。更重要的特點是數百種帶有螢光Abeads結合物與帶有螢光B的對應抗體,因專一性可與數百種標的物結合,可以在同一次反應中進行。

圖三

接著,利用流式微粒螢光分析儀來分析實驗的結果。目前市面上有多家不同廠牌的分析儀可使用,第七共研目前使用的是Labscan100。此儀器是一台類似流式細胞儀的96孔盤分析儀,具備二支雷射光源(如圖四)。一支為Bead Classification Laser,可以區別鑑定出100種以上不同螢光染劑的polystyrene beads (圖五),因此一個反應孔可偵測100種以上標的物,以達到multiplexing目的﹔另外一支則為Reporter Laser,用以偵測antibody或核酸上的螢光B標的。配合實驗所建立的定量標準曲線(標的物濃度vs.螢光量),即可推測樣品內不同標的物的含量,例如:同時偵測血漿中促發炎cytokines (IL-2, INF-γ)和抑發炎cytokines (IL-4, IL-10)的含量。

圖四

圖五

每一個反應試管中最少需要12μl serum50μlcell lysate,對於珍貴的實驗樣品,例如組織及腫瘤切片、小鼠血液或新生兒血液的分析,即可藉由xMAP technology分析套組和微粒螢光分析儀達到multiplex detection的目的。此系統應用在蛋白質(cytokinesantibody isotypingchemokinesgrowth factorsphosphoproteins)的分析。此外,儀器也可以應用於xTAG xxxxxxtechnology平台,主要是進行核酸(病原菌、病毒、基因表現及SNP)的分析。

使用說明

第七共同研究室提供「細胞免疫影像分析儀」與「流式微粒螢光分析儀」,歡迎研究人員使用。研究人員參加講習後可自行操作儀器。實驗室管理人員為袁惠萍小姐,分機:63162,電子信箱 hpyuan@ntuh.gov.tw,若有任何問題,歡迎來電或來信討論。
 


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科學新知

基因組編輯(Gene Editing)技術之最新發展

第一共同研究室 黃呈彥博士 
 

基因组编輯(genome editing)技術主要依賴一些識别特定序列的核酸酶在DNA上切割,造成雙股DNA斷裂,進而利用非同源末端接合機制(non-homologous end joining, NHEJ)來修復DNA斷點,由於極易發生錯誤(缺失/插入)進而造成移碼突變,因此可以達到基因剔除的目的;或是利用同源重组機制(homologous recombination)針對斷點附近的基因序列進行序列置換(HDR, homology direct repair)。近年來,基因组编輯的實驗技術有了快速的進展,其中TALEN以及CRISPR技術因其載體易構築,以及突破物種限制的優點,迅速被科學家們接受並應用於基因功能的研究

TALEN (Transcription Activator-Like Effector Nuclease)是一種人工改造的限制性內切酶,將TALE(Transcription Activator-Like Effector,由植物致病細菌Xanthomonas所分泌具有轉錄激活功能的蛋白)DNA結合區與限制性內切酶(Fok I)DNA切割區融合而得到。經由設計並組裝好的TALEN質體在細胞中表達,可專一的與基因靶位點結合,形成二聚體切割spacer區域雙股DNA。

CRISPR/Cas (Clustered regularly interspaced short palindromic repeats and CRISPR-associated systems) 是將來自於化膿性鏈球菌(Streptococcus pyogenes)Cas9蛋白與guide RNA形成一個複合體,由guide RNA上的Protospacer序列(18~20nt)辨識DNA,緊接在Protospacer序列之後的三個核苷酸(NGG)稱為Protospacer adjacent motif(PAM)Cas9即辨識PAM並切割緊鄰的雙股DNA。其後又發展出只切割單股DNACAS9 Nickase以降低脫靶效應(off target effect)

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共同研究室貴重儀器訓練暨研究新知課程 

儀器訓練課程:課程網路報名

  6月24日 多功能光學顯微鏡式細胞儀之原理與實機示範課程(LEICA DRM)
  6月25日 免疫斑點影像分析儀之操作訓練課程(C.T.L.;ImmunoSpot)
  7月02日 分光光度計(Spectrophotometer)之操作訓練課程(BECKMAN DU-640B)
  7月02日 高速冷凍離心機之操作訓練課程(BECKMAN Allegra X-12R)

研究新知課程:課程網路報名 

  6月11日  微量蛋白偵測新技術--類聲波薄膜(AMMP) 
  6月26日  Cell-based腫瘤侵襲遷移研究方法--技術與新知 
  7月08日 四階段 In vivo/In vitro 電穿孔轉殖系統

歡迎您訂閱共同研究室電子報以收取儀器訓練與研究新知課程講習相關資訊 。

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為持續提供優質之研究服務,便於日後聘用專職技術人員、購置新儀器、現有儀器汰舊換新與維護保養等等,敬請於使用共同研究室資源並發表論文時,於論文致謝(Acknowledgement)處加入致謝共同研究室之文句,並於論文發表時通知共同研究室管理人員。致謝文句請依實際使用情形書寫,或請參考以下範例:We thank the staff of the Core Labs, Department of Medical Research, National Taiwan University Hospital for technical support.
 

第六期                                                                                                                                                                                                   JUN.10.2014