醫學研究部 吳侑靜博士/陳家怡研究助理 

聚焦式超音波粉碎儀 (Covaris)

在生命科學領域的研究過程中，樣品前處理通常是關鍵的一步。為了獲得適當大小的核酸、蛋白質分子以供後續實驗使用，研究者通常需對樣品進行均質化或片斷化。然而利用傳統的探針式超音波破碎法，其高產熱對樣品的損害較大，直接接觸樣品也可能產生交叉污染，對實驗結果的穩定性及再現性較差，而Covaris超音波震裂機可適時解決以上問題。利用專利的聲能聚焦技術 (Adaptive Focused Acoustics, AFA)，在恆溫下對核酸進行片斷化或組織均質化，可確保樣品完整性；透過非接觸且能量可控制的圓盤狀傳感器將聲波聚焦在樣品上，有效地將樣品裁切成精確的片段大小，獲得高再現性的結果。本產品適用於 NGS 的核酸片段化、FFPE 或全血樣品的 DNA 萃取、蛋白質生物標記的萃取等各種應用。核酸定序核心目前設置的 M220 可處理體積 130ul 的核酸樣品，提供 150bp 至 3kb 不同長度核酸片斷化的標準設定。

針對NGS快速地發展, 核酸片斷化為定序過程中決定性的第一個步驟。目前雖然有許多核酸片斷化的方法, 但是機械式的片斷化仍是提供高敏感以及無實驗偏差的最佳方法。Covaris的AFA過程是在等溫的條件下進行，可確保核酸樣品的完整，另外配合特別研發的AFA Tubes，可正確精準地將DNA及RNA片斷化至150~1500bp (microTUBE)，或2-5kb (miniTUBE); AFA超音波粉碎儀針對不同功能需求設計多款機型，包含小型的M-Series、全功率的S-Series以及單管設計等。針對較大片斷DNA定序的應用，Covaris也研發具專利的gTUBE, 可選擇DNA片斷化的範圍從6kb~20kb，簡單的配合桌上型離心機, 即可有效地利用離心所產生的剪力達到DNA片斷化。

本核心設置的機型為M220，提供微量樣品處理，可處理體積 130ul的核酸樣品，其特點如下：

• 內置冷卻系統，防止樣品過熱損壞提高回收率，不須外接冷卻系統

• 密閉式系統，無交叉污染與樣品蒸散的問題

• 自動化操作，全電腦介面設定

• 彈性化條件設定，提供 150bp至 3kb不同長度核酸片斷化的標準設定

• 搭配專用之試劑套組，不需要有機溶劑即可乳化 FFPE樣品，方便去除樣品中的石蠟，完成組織復水，萃取FFPE樣品之核酸

以上資料感謝均泰生物科技公司提供，更多關於 M220之資訊請參考 Covaris官網連結:

http://www.gtbiotech.com.tw/products/DNA_RNA_Shearing.asp

有興趣使用的同仁，非常歡迎與我們聯絡討論!!

核酸定序核心尚有其他NGS相關服務，包含樣本核酸萃取、基因庫製備及定序、大數據生資分析及Sanger定序，歡迎大家來洽詢使用，諮詢實驗設計免費喔~!

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