醫學研究部 郭俊宏先生 

Qsep100是一台由臺灣自行研發的全自動毛細管電泳核酸分析儀，採用創新的筆型預鑄膠體卡匣，以簡單的操作整合了傳統電泳的繁雜步驟：樣品準備、製膠、進樣、跑膠、照膠、結果判讀，一次完成，提供使用者快速、高解析、高靈敏的核酸分離結果。目前已經有5種卡匣可供選擇，可依照實驗需求抽換不同配方的卡匣；卡匣可室溫保存，隨插即用，不需人工注膠，省下繁瑣的準備時間並降低人為操做可能的失誤。分析軟體 Q-Analyzer簡單易上手，可以把實驗結果以報告的格式呈現出來，分析功能包含：Standard DNA/RNA QC、Smear Analysis、Peakcalling Analysis、NGS Library QC等。

儀器特點：

全自動上樣：以電動進樣的原理自動將樣本與Alignment Marker混合，無需手工操作。通量彈性：可單次分析單個樣品，也可96個樣品整盤上樣，不會有額外的耗材浪費。隨插即用式卡匣：無需制膠、灌膠，每支卡匣可分析100-300樣品。快速分析：2~7分鐘/樣品高靈敏度：可達pg等級高解析度：最佳可達4bp結果呈現：數位資料、毛細管電泳圖、凝膠成像圖上樣體積：一般PCR管子16uL~20uL，使用專用管子最低1uL。

應用實例：

￭ NGS Library QC

Qsep的分析軟體Q-Analyzer支援各式次世代定序應用，Library QC、Total RNA QC、Genomic DNA QC，計算平均片段長度，相對濃度定量等常見功能，提供完整的NGS解決方案。使用者可選定或自訂欲分析產物之上下界，即可得到Average bp、眾數、各區間所占百分比等資訊；此外也可檢查有無形成 adapter dimer。

￭ cfDNA QC

cfDNA有幾個重要的特性：平均長度約為170bp (<200bp)、不易保存、含量稀少。抽完cfDNA後，因為有可能同時也抽到Gemomic DNA，不能只用Qubit確認濃度，還需以確認樣本的Size，判斷使否能進行後續的實驗。因cfDNA濃度低，建議使用高靈敏的 N1, High resolution Cartridge進行偵測。

　左圖是有抽到Genomic DNA的cfDNA樣本，Genomic DNA的部分會一起被列入濃度計算
  右圖是抽得好的cfDNA，片段分布在150~200bp

￭ 分子輔助育種

親代的SSR重複數不同，如果是成功雜交的子代，該SSR區域的PCR產物在兩個allele會同時具有父代和母代的重複數，也就是會有兩種不同長度的產物；而如果發生自交的話則只會有單一種長度的產物。但這樣的PCR產物差異可能只有幾個bp，傳統的膠體電泳沒辦法區分這樣的差距，只能選擇利用核酸定序的方式確認。現在，我們可以利用毛細管電泳高解析的特性，清楚分辨產物重複數的差異，作為分子輔助育種的工具。

儀器使用聯絡資訊:

吳侑靜博士 分機: 66680
  郭俊宏先生 分機: 63271

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