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單細胞研究

單細胞研究正在改變我們對生物系統的理解。傳統基因組學技術提供了組織或細胞群體的平均信息，然而，這種方法無法揭示個體細胞間的異質性。單細胞基因組學分析則突破了這一侷限，能夠探索細胞異質性，追蹤細胞分化軌跡，揭示基因調控網絡。隨著單細胞分析技術的進步，能讓科學家們能更精準地進行單細胞的探索。　

單細胞分析解決方案 (10x Chromium Single Cell)

10x Genomics開發的Chromium單細胞分析平台，採用創新的微流道調控技術，將每個細胞與條形碼凝膠珠(Gel Bead)包裹在微小液滴中。結合次世代定序技術，生成基因表達數據，並通過專屬的Cell Ranger和Loupe Browser軟體，或第三方分析工具，實現簡單直觀的數據處理與視覺化分析。高效的單細胞分辨率和條形碼標記技術，可精準地解析每個細胞的基因表達數據。在Chromium最新開發的GEM-X技術中，重新設計的微流道晶片和優化的化學試劑，更進一步提升了單細胞檢測效率與數據品質(圖1)。

圖1. GEM-X技術提升單細胞檢測效能
　

基於GEM-X技術的創新應用: Universal Multiplex和Flex Gene Expression

10x Genomics推出的兩項新應用—GEM-X Universal Multiplex和Flex Gene Expression，為科學家提供更高效、更靈活的實驗設計選擇(圖2)。

GEM-X Universal Multiplex Gene Expression，透過RT-based poly-A RNA capture技術，結合On-Chip Multiplexing (OCM)新晶片設計(圖3)，每個反應最多可支援 4 個樣本混合分析；此應用消除了上游樣品標籤化的需求，顯著提升了不同類型樣本混樣的靈活性，同時降低了每次實驗所需的細胞輸入量。這種高效且彈性的設計，讓實驗設計更加簡化，適用於多樣性樣本研究。

GEM-X Flex Gene Expression是利用探針偵測(Probe-based)的方法，專為固定後的樣本(Fixed Sample)設計，進行全基因表達分析。科學家可在細胞固定後再進行後續實驗操作，這一特性為多中心收樣及多時間點收樣等實驗設計提供了極大便利性。此技術適用範圍廣泛，可包括石蠟包埋(FFPE)分離的樣本，為困難樣本處理提供了解決方案。此外，探針標定技術允許每次上機最多可混合16種樣本(圖4)。

圖2. GEM-X Universal Multiplex和Flex Gene Expression技術原理與特性
　

圖3.GEM-X Universal Multiplex Gene Expression消除樣本逐一標定的前處理步驟。每反應最多可混合4個樣本
　

圖4.GEM-X Flex Gene Expression技術，經探針標定(Probe-based)方法分析固定樣本(Fixed Cells)，提升實驗安排彈性與自由度

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